En fait des éléments épars qui nous sont livrés, la première forme de la Manticore est la forme actuelle prise par Boogiepop Phantom.
Avant l'avènement du rai de lumière, le vrai Saotome a fait la même chose que Misuzu. Par un apparent désenchantement de la vie (aperçu dans l'épisode 1) il a en fait une peur totale de mourir et s'est associé à la Manticore dans une relation symbiotique. L'épisode 4 nous dévoile sa façon d'agir en voulant (encore comme Misuzu) adapter le monde à son désir, en l'apprivoisant par une drogue spéciale. Et la confiance obtenue est la nourriture du monstre.

Nagi s'est opposée à Saotome, et il y a eu les événements qui ont conduit au pilier de lumière. Saotome s'est précipité dans la colonne de lumière pour empêcher la mort de la Manticore, et a disparu. C'est à ce moment qu'est né Boogiepop Phantom. Dans les bribes de mémoire des différents protagonistes, elle a revêtu l'apparence de la Manticore. Et cette dernière a survécu sous l'apparence de Saotome.
Boogiepop Phantom n'est donc qu'un hologramme du shinigami original, qui est en toile de fond de toutes les intrigues. Et c'est pourquoi il n'apparaît qu'à cause d'événements fortuits. La peur de la mort de Saotome, et la matrice du monstre a invoqué le dieu de la mort, qui doit maintenant s'occuper des répercussions de sa venue.

Ces éléments sont confirmés dans l'épisode 8, qui constitue avec les épisodes 5 et 11 les épisodes-clés pour une présentation explicite des événements. Mais, même s'il semble que l'on nous dit tout, c'est un artifice pour mieux nous cacher d'autres choses qui resteront à jamais invisibles et floues.